沼气作为一种新能源，应用越来越广泛。我国环保标准中严格规定，使用沼气时，沼气中的H2S含量不得超过20mg/m3。必须尽可能地去除工业和民用气体中的H2S。
当沼气从厌氧发酵装置中产生时，特别是在中高温下发酵时，它携带大量的H2S。由于沼气中仍有大量水蒸气，水和沼气中的H2S共同作用，加速了金属管道、阀门、流量计的腐蚀和堵塞。此外，H2S燃烧后产生的SO2与燃烧产物中的水蒸气结合形成亚硫酸，对设备的金属表面造成腐蚀，还污染大气环境，影响人体健康。因此，在使用沼气之前，必须除去其中的H2S。
工业上常用的沼气脱硫方法有干法脱硫、湿法脱硫和生物脱硫。
干法脱硫是一种简单、高效、成本相对较低的脱硫方法，一般适用于沼气量少、硫化氢浓度低的沼气脱硫。沼气干法脱除硫化氢(H2S)设备的基本原理是用O2将H2S氧化成硫或硫氧化物的方法，也可称为干法氧化法。干法工艺设备的组成是在容器中放置填充物，填充物层包括活性炭、氧化铁等。气体以低流速从一端穿过容器中的填料层。硫化氢(H2S)被氧化成硫磺或氧化硫后，残留在填料层中，净化后的气体从容器的另一端排出。
湿法脱硫可分为物理吸收法、化学吸收法和氧化法。而物理和化学方法都有硫化氢再处理的问题。氧化法以碱性溶液为吸收剂，氧载体为催化剂，吸收H2S并将其氧化成单质硫。湿式氧化法将脱硫剂溶解在水中，液体进入设备与沼气混合。沼气中的硫化氢(H2S)与液体反应生成单质硫吸收硫化氢，如氢氧化钠、氢氧化钙、碳酸钠、硫酸亚铁等。成熟的氧化脱硫法，脱硫效率高达99.5%以上。
在大型脱硫工程中，一般采用湿法进行粗脱硫，然后采用干法进行精脱硫。
生物脱硫技术包括生物过滤、生物吸附和生物滴滤。三个系统都是开放系统，它们的微生物种群随着环境的变化而变化。在生物脱硫过程中，被氧化的含硫污染物必须先被还原成硫化物或H2S，然后再被氧化成单质硫才能被脱除。在大多数生物反应器中，微生物种类主要是细菌，其次是真菌，很少有酵母。常用的细菌有氧化亚铁硫杆菌、脱氮硫杆菌和硫杆菌。最成功的代表是氧化亚铁硫杆菌，其生长是最好的p。